Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM61Q5EBN2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms