Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAMK4Q16566 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms