Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SYPL1Q16563 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SYPL1Q16563 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SYPL1Q16563 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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