Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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