Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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