Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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