Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PLD1Q13393 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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