Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4BQ07343 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms