Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms