Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME1Q06323 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME1Q06323 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME1Q06323 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME1Q06323 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms