Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms