Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2FP61218 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms