Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IDH3AP50213 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms