Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIP4K2AP48426 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms