Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRATP43155 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRATP43155 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRATP43155 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRATP43155 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRATP43155 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms