Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms