Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCAP28676 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms