Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms