Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRHP20396 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRHP20396 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRHP20396 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRHP20396 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRHP20396 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRHP20396 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms