Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMP1P11279 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMP1P11279 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms