Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MCF2P10911 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MCF2P10911 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.6 ms