Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK1O75385 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms