Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5DQ9BY66 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms