Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TCF23Q7RTU1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms