Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms