Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms