Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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