Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms