Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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