Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms