Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK2BP67870 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2BP67870 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms