Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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