Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms