Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms