Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms