Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PTPRBP23467 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRBP23467 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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