Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HRCP23327 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HRCP23327 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms