Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms