Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms