Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAG9O60271 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPAG9O60271 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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