Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HOXA3O43365 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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