Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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USP17L12C9JPN9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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USP17L12C9JPN9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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USP17L12C9JPN9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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USP17L12C9JPN9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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