Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms