Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLKQ9UBT6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms