Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDE1Q9NZC3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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