Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms