Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms