Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms