Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms