Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN1Q8WXD9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms